Ligaza DNA (ATP, ADP lub GTP) EC#: 6.5.1.7; ChemWhat Kod: 1383899
Nazwa produktu | Ligaza DNA (ATP, ADP lub GTP) |
Przykładowa struktura | |
Synonimy | Ligaza DNA Hbu, ligaza DNA zależna od wielu kofaktorów, ligaza DNA Szi |
Numer WE | 6.5.1.7 |
Numer rejestru CAS | |
Komentarze | Enzymy z archeonów „Hyperthermus butylicus” i „Sulfophobococcus zilligii” są aktywne z ATP, ADP lub GTP. Nie wykazują żadnej aktywności z NAD +. Enzym katalizuje ligację nici DNA z końcami 3'-hydroksylowymi i 5'-fosforanowymi, tworząc fosfodiester i uszczelniając pewne typy pęknięć pojedynczej nici w dupleksowym DNA. Kataliza zachodzi w trzystopniowym mechanizmie, zaczynając od aktywacji enzymu przez ATP, ADP lub GTP, tworząc wiązanie fosforamidowe między adenylanem / guanylanem a resztą lizyny. Nukleotyd jest następnie przenoszony na koniec 5'-fosforanowy substratu, tworząc zamkniętą strukturę 5 '- (5'-difosfoadenozyny / guanozyna) - [DNA]. Wreszcie, enzym katalizuje nukleofilowy atak końca 3'-OH na końcu zakrytym, co skutkuje utworzeniem wiązania fosfodiestrowego i uwolnieniem nukleotydu. Różni się od EC ™ 6.5.1.1 ligaza DNA (ATP) i EC ™ 6.5.1.6, ligaza DNA (ATP lub NAD +), która nie może wykorzystywać GTP. |
Kofaktor | |
Historia | |
Reakcje | (1) Atp + (deoksyrybonukleotyd) (n) -3′-hydroksyl + 5′-fosfo- (deoksyrybonukleotyd) (m) = (deoksyrybonukleotyd) (n + m) + Amp + difosforan. (2) Adp + (deoksyrybonukleotyd) (n) -3′-hydroksyl + 5′-fosfo- (deoksyrybonukleotyd) (m) = (deoksyrybonukleotyd) (n + m) + Amp + fosforan. (3) Gtp + (deoksyrybonukleotyd) (n) -3′-hydroksyl + 5′-fosfo- (deoksyrybonukleotyd) (m) = (deoksyrybonukleotyd) (n + m) + Gmp + difosforan. |
Kup odczynnik | |
Brak dostawcy odczynników? | Wyślij szybkie zapytanie do ChemWhat |
Chcesz być wymieniony tutaj jako dostawca odczynników? (Usługa płatna) | Kliknij tutaj, aby się skontaktować ChemWhat |
Zatwierdzeni producenci | |
Chcesz być wymieniony jako zatwierdzony producent (wymaga zatwierdzenia)? | Proszę pobrać i wypełnić ta forma i odeślij do [email chroniony] |
Skontaktuj się z nami, aby uzyskać inną pomoc | |
Skontaktuj się z nami, aby uzyskać inne informacje lub usługi | Kliknij tutaj, aby się skontaktować ChemWhat |