Ligaza DNA (ATP, ADP lub GTP) EC#: 6.5.1.7; ChemWhat Kod: 1383899

Nazwa produktu Ligaza DNA (ATP, ADP lub GTP)
Przykładowa struktura Przykład Struktura ligazy DNA (ATP, ADP lub GTP) EC #: 6.5.1.7
Synonimy Ligaza DNA Hbu, ligaza DNA zależna od wielu kofaktorów, ligaza DNA Szi
Numer WE 6.5.1.7
Numer rejestru CAS
Komentarze Enzymy z archeonów „Hyperthermus butylicus” i „Sulfophobococcus zilligii” są aktywne z ATP, ADP lub GTP. Nie wykazują żadnej aktywności z NAD +. Enzym katalizuje ligację nici DNA z końcami 3'-hydroksylowymi i 5'-fosforanowymi, tworząc fosfodiester i uszczelniając pewne typy pęknięć pojedynczej nici w dupleksowym DNA. Kataliza zachodzi w trzystopniowym mechanizmie, zaczynając od aktywacji enzymu przez ATP, ADP lub GTP, tworząc wiązanie fosforamidowe między adenylanem / guanylanem a resztą lizyny. Nukleotyd jest następnie przenoszony na koniec 5'-fosforanowy substratu, tworząc zamkniętą strukturę 5 '- (5'-difosfoadenozyny / guanozyna) - [DNA]. Wreszcie, enzym katalizuje nukleofilowy atak końca 3'-OH na końcu zakrytym, co skutkuje utworzeniem wiązania fosfodiestrowego i uwolnieniem nukleotydu. Różni się od EC ™ 6.5.1.1 ligaza DNA (ATP) i EC ™ 6.5.1.6, ligaza DNA (ATP lub NAD +), która nie może wykorzystywać GTP.
Kofaktor
Historia
Reakcje (1) Atp + (deoksyrybonukleotyd) (n) -3′-hydroksyl + 5′-fosfo- (deoksyrybonukleotyd) (m) = (deoksyrybonukleotyd) (n + m) + Amp + difosforan. (2) Adp + (deoksyrybonukleotyd) (n) -3′-hydroksyl + 5′-fosfo- (deoksyrybonukleotyd) (m) = (deoksyrybonukleotyd) (n + m) + Amp + fosforan. (3) Gtp + (deoksyrybonukleotyd) (n) -3′-hydroksyl + 5′-fosfo- (deoksyrybonukleotyd) (m) = (deoksyrybonukleotyd) (n + m) + Gmp + difosforan.

Kup odczynnik

Brak dostawcy odczynników? Wyślij szybkie zapytanie do ChemWhat
Chcesz być wymieniony tutaj jako dostawca odczynników? (Usługa płatna) Kliknij tutaj, aby się skontaktować ChemWhat

Zatwierdzeni producenci

Chcesz być wymieniony jako zatwierdzony producent (wymaga zatwierdzenia)? Proszę pobrać i wypełnić ta forma i odeślij do [email chroniony]

Skontaktuj się z nami, aby uzyskać inną pomoc

Skontaktuj się z nami, aby uzyskać inne informacje lub usługi Kliknij tutaj, aby się skontaktować ChemWhat